當生物科技應用在養殖漁業上，我們可以獲得更具經濟價值的水產生物。例如三倍體技術，讓原本生物只有兩條的染色體變成三條，這些「三倍體」的生物雖然沒有生殖能力，但是卻可以把從食物獲得的能量用在身體的成長上，所以不但生長效率快，體積也會比較大，目前這項技術已經使用在牡蠣、泥鰍、鮭魚、鯛魚、鱸魚等生物養殖上。另外還有「基因轉殖技術」，目前最有名的例子是「螢光魚」，研究人員原本是為了方便追蹤、觀察實驗過程，而把水母的綠色螢光蛋白基因，或珊瑚的紅色螢光蛋白基因注射到魚的受精卵裡，培育出帶有水母或珊瑚螢光特徵的螢光魚，卻也意外開發了觀賞魚的新市場。不過，跨物種的基因轉殖技術，還是有環境、文化上的爭議，所以必須謹慎的評估和使用。