種魚的取得與培育，是進行人工繁殖及生產魚苗的首要工作。培育種魚時，淡水魚、河口性或沿岸性海水魚可利用池塘，但棲息在珊瑚礁或大洋裡的魚類，因喜好清澈水域，就必須利用海上箱網進行培育。種魚培育階段，餵食富含油脂的餌料可以確保孵化魚苗的品質，是未來人工繁殖成功與否的關鍵。